В Центре специальных экспертиз по Южному округу на постоянной основе создана аттестационно-экзаменационная комиссия по аттестации экспертов на право самостоятельного производства экспертиз, в состав которой вошли профессора, доценты, доктора и кандидаты различных наук, руководители нескольких экспертных учреждений Ростовского региона, Республики Крым, Приволжского федерального округа.

Центром ведется научная работа. За долгий период работы, экспертами Центра совместно с правоохранительными органами (СУ СК РФ по РО; Южный СУТ СК России; ГСУ ГУ МВД России по РО; Ростовским областным судом; Арбитражным судом Ростовской области; Пятнадцатым арбитражным апелляционным судом; ЮРЦ МЧС России; Управлением Федеральной налоговой службы по Ростовской области) подготовлены и выпущены:

• Практическое пособие по назначении экспертиз (для следователей, судей, экспертов). Издавалось в 2006, 2007, 2008годах;
• Рекомендации по вынесению определений и постановлений по назначению судебных экспертиз. Издавались в 2009, 2010, 2012годах;
• Методика расследования дел по дорожно-транспортным происшествиям. Издавалась в 2009, 2010, 2012годах;
• Участие специалиста в следственных действиях. 2010г;
• Теория судебной экспертизы. 2010г;
• Методика рассмотрения дел, связанных с нарушением правил охраны труда и безопасности при проведении работ, 2012г;
• Методика рассмотрения дел, связанных с пожарами и поджогами. 2012г;
• Пособие по назначению экспертиз при осуществлении налогового контроля. Издавалось 2011, 2012, 2015годах;
• Сборник «Криминалистические и экспертные методики». В сборник вошли 4 криминалистических и 11 экспертных методик. Сборник издавался в 2014, 2015годах;
• Сборник «Методики искусствоведческих экспертиз». В сборник вошли 3 методики. Сборник издавался в 2015году
• Методика проведения нумизматических экспертиз. г. Ростов-на-Дону, 2016 г.
• Методика исследования ювелирных изделий. г. Ростов-на-Дону, 2017 г.
• Экспертиза орденов советского периода. г. Ростов-на-Дону, 2018 г.
• Экспертиза мебели. г. Ростов-на-Дону, 2018 г.
• Экспертиза русской посуды из фарфора (период возникновения- начало ХХвека). г. Ростов-на-Дону, 2019 г.
• Рекомендации по назначению фоноскопических и видеотехнических экспертиз.  г. Ростов-на-Дону, 2019 г.

Центр специальных экспертиз по Южному округу выступил коллективным рецензентом «Научно-практического комментария к „Федеральному закону „О государственной судебно-экспертной деятельности в Российской Федерации““», опубликованного в 2007году.

Эксперты Центра являются авторами свыше 20 научных статей, опубликованных в журналах «Эксперт-криминалист», «Российская юстиция», «Российский судья».